האובדן הנורא של חיי אדם ובתים תועד היטב, אך גם לפגיעה באוכלוסיות ציפורים, יונקים, דגים וחרקים הקשורים להרס בתי הגידול שלהם תהיה השפעה ארוכת טווח על המערכת האקולוגית.
שומות, קיפודים, גיריות, עכברים, תולעי אדמה ושלל חרקים וציפורים הם הקורבנות הבלתי נראים של שיטפונות, סערות וגשמים עזים לאחרונה.
ברגע שמפלס המים החל לרדת באנגליה, דיווחו שוחרי איכות הסביבה כי כ-600 פגרי ציפורים - אלוקים, חתלתולים ושחפים - נשטפו בחוף הדרומי, כמו גם 250 כלבי ים שטבעו למוות בנורפוק, קורנוול ואיי התעלה. דווח על מותם של עוד 11 עופות ים מול חופי צרפת.
סערות בלתי פוסקות פקדו את המדינה. בעלי החיים יכולים בדרך כלל להתמודד עם מזג אוויר גרוע, אך כיום חסר להם אספקת מזון והם מתים בכמויות גדולות. דייויד ג'רוויס, מנהל ה-British Divers Marine Life Rescue, אמר שהארגון שלו מעורב מאוד בהצלת כלבי ים: "עשינו 88 גיחות מאז ינואר כדי להציל חיים ימיים, הרוב המכריע של בעלי החיים שנפגעו היו גורי כלבי ים".
כמה מושבות כלבי ים נמחקו ומאות נמצאו לאורך החופים מתים, פצועים או חלשים מכדי לשרוד. בין האזורים שנפגעו הכי קשה הם לינקולנשייר, נורפולק וקורנוול.
הנזק נגרם ל-48 מאתרי חיות הבר החשובות ביותר בבריטניה, כולל מספר שמורות לאומיות. טים קולינס, מומחה לחיות הבר באנגליה, אמר: "ההערכה היא שכ-4 הקטרים של אזורים מוגנים של חיות בר חופיות באנגליה הוצפו.
אזורים שנפגעו במיוחד כוללים אזורי מרעה וביצות חופיות, לגונות מלח ואגמון. לכל האתרים הללו חשיבות לאומית, ו-37 מהם גם בעלי חשיבות בינלאומית.
היקף והיקף ההשפעה של השיטפון על מינים רבים עדיין מוערכים, אך בעלי החיים החורפים צפויים להיות המושפעים ביותר.
שרקנים טובעים אם השיטפון מהיר. אם זה היה איטי יחסית, הם היו יכולים לסגת, אבל זה היה מביא אותם לעימות עם שכניהם, הם היו נלחמים ופוצעים אחד את השני.
מארק ג'ונס מהאגודה הבינלאומית להומאני אמר שגם בעלי חיים רבים אחרים נפגעו: "כמה משפחות גיריות נמחקו כמעט לחלוטין".
דבורי בומבוס, תולעי אדמה, חלזונות, חיפושיות וזחלים היו כולם בסיכון מהצפות ואדמות ביצות. אנו יכולים לצפות לפחות פרפרים השנה.
עובש הוא אויב קטלני של חרקים. המשמעות היא שייתכן שיהיו פחות זחלים שהציפורים ניזונות מהם.
שלדגים הלוכדים דגי נהרות סבלו מאוד מכיוון שגשמים ושיטפונות הביאו כל כך הרבה סחופת שהמים הפכו לבוציים מדי. ציפורים משכשכות כמו צלף יתקשו אם ההצפה נמשכת במהלך עונת הקינון שלהן. עופות ים מתו באלפים במהלך הסופה האלימה.
השיטפונות תבעו אלפי טונות של קרקע עליון פורה, אך אם הם יימשכו, ההשלכות עלולות להיות גרועות בהרבה.
לאחר מספר שבועות מתחת למים מתחילים הצמחים להתפרק, מה שמוביל למחסור בחמצן ולשחרור גזים רעילים. אם מי השיטפונות זוהמו בחומרי הדברה או בכימיקלים תעשייתיים רעילים אחרים, ההשפעות עלולות להיות הרסניות.
אבל לא הכל חדשות רעות. אפילו כמה מיני דגים נפגעו. קרוב ל-5000 דגים, למשל, נמצאו מתים בשדות ליד גרינג על התמזה באוקספורדשייר לאחר שהנהר הציף אותם ואז המים שככו. "כאשר שיטפונות קורים, אתה יכול גם לאבד דגיגים, הם פשוט ייסחפו במים", אמר מרטין סלטר מתאגיד הדיג.
מאות עצים עתיקים - כולל אלונים ואשורים בני 300 שנה - נפלו בסערות בשלושת החודשים האחרונים. הקרן הלאומית מדווחת שבאזורים מסוימים לא נראו נזקים כאלה מאז הסופה הגדולה של 1987. ועדת היערות מעריכה שהסערה של סנט ג'וד בנובמבר הרגה 10 מיליון עצים.
תולעי אדמה שעומדות לתרדמה ונושמות דרך עורן נפגעו קשה מגשמי החורף הכבדים ביותר שתועדו אי פעם בבריטניה. הם אוהבים אדמה לחה, אך פגיעים מאוד לריבוי מים והצפות. עשרות אלפי תולעים נחנקו במהלך שיטפונות, ולאחר מכן נותרו שרצים, שומות, כמה חיפושיות וציפורים ללא מזון.