לעתים קרובות זיהומים פטרייתיים נובעים מחוסר איזון פשוט של מיקרואורגניזמים הקיימים באופן טבעי בגוף.

הוא למעשה מושב על ידי שפע של פטריות וחיידקים מגוונים, רוב הזמן לא מזיק ואפילו חיוני לתפקוד תקין של הגוף.

עם זאת, זה עלול לקרות שחלק מהפטריות הללו מתרבות והופכות לפתוגניות, או שפטרייה "חיצונית", המועברת למשל על ידי בעל חיים, גורמת לזיהום. בסך הכל 200-400 מיני פטריות יכולים לגרום למחלות בבני אדם⁵.

עם זאת, פטריות הקיימות בסביבה יכולות גם לזהם בני אדם, למשל:

• על ידי חיסון, במהלך פציעה למשל (המוביל לספורוטריכוזיס או כרומיקוזיס וכו ');
• על ידי שאיפת עובש (היסטופלסמוזיס, אפרגילוזיס וכו ');
• במגע עם אדם נגוע (קנדידה, גזזות וכו ');
• באמצעות מגע עם בעל חיים נגוע.