סימפטומים מופיעים בין 10 ו-15 ימים לאחר נשיכת החרק הנגוע. סוגים מסוימים של טפיל מלריה (פלסמודיום vivax et Plasmodium ovale) עלול להישאר לא פעיל בכבד במשך שבועות או אפילו חודשים לפני הופעת הסימנים הראשונים.

מלריה מאופיינת בהתקפים חוזרים הכוללים שלושה שלבים:

• צמרמורת;
• כאבי ראש;
• עייפות וכאבי שרירים;
• בחילה והקאה;
• שלשול (מדי פעם).

כעבור שעה או שעתיים:

• חום גבוה;
• העור הופך חם ויבש.

ואז טמפרטורת הגוף יורדת:

• הזעה מרובה;
• עייפות וחולשה;
• האדם הפגוע נרדם.

זיהומים במלריה P. vivax ו- P. ovale עלולים להישנות מספר שבועות או אפילו חודשים לאחר ההדבקה הראשונה גם אם החולה עזב את אזור ההדבקה. הפרקים החדשים הללו נובעים מצורות כבד "רדומות".