צריכה גבוהה של חלבון עלולה להחמיר או להגביר את הסיכון למחלת כליות, עבור אנשים עם נטייה אליהם, שכן עליה בצריכת חלבון מגבירה את רמת הסינון הגלומרולרי (GFR).
לסוג החלבון הנצרך יש גם השפעה שבה לחלבונים מהצומח יש השפעה מועילה יותר על UGF מאשר חלבונים מהחי.
כתוצאה מהניסויים, הוכח ש לאחר אכילת ארוחות המכילות חלבון מן החי, UGF (קצב סינון גלומרולרי) היה גבוה ב-16% מאשר לאחר אכילת ארוחות עם חלבון סויה.
מאחר והפתולוגיה של מחלות מערכת גניטורינארית קרובה לפתולוגיה של טרשת עורקים, הורדת רמות הכולסטרול בדם והפחתת חמצון הכולסטרול, כתוצאה מתזונה צמחונית, יכולה להועיל ביותר גם לסובלים ממחלות כליה.